非小细胞肺癌MET基因检测的路径和流程
编者按:MET基因改变在非小细胞肺癌中的作用目前已经得到证实。针对MET基因改变的靶向药物具有明显的临床疗效。由于MET基因改变涉及到MET ex14跳突、基因扩增和蛋白过表达,因此,临床上需要针对MET基因的不同改变进行相应的检测。本篇文章针对非小细胞肺癌中MET基因检测应遵循的路径和流程中相关问题做了介绍。
非小细胞肺癌MET基因检测的路径和流程
  2022年中华医学会病理学分会、国家病理质控中心、中华医学会肿瘤学分会肺癌学组、中国抗癌协会肺癌专业委员会、中国胸部肿瘤研究协作组联合发布的《非小细胞肺癌MET临床检测中国专家共识》中指出:检测医师应根据需要检测MET异常形式,结合送检样本类型、所检基因数量及类型、检测成本、检测实验室能力条件以及试剂获证情况等综合评估,合理选择检测方法,必要时考虑进行多平台相互验证。本共识基于现阶段证据及临床实践,专家组推荐NSCLC MET检测路径如图1所示。未来根据相关证据公布,检测路径可能做进一步更新。对于肿瘤组织/细胞学样本可取的患者,根据实验室平台可及性,优先推荐进行包含EGFR、KRAS、ALK、 ROS1、RET及 MET等基因在内的多基因联检[1],以便最大化利用样本获得较全面的基因信息。当组织/细胞学样本充足时,推荐二代测序平台或多基因RT-qPCR平台;当组织/细胞学样本不足时,可根据临床需求与临床病理特征首选相关单基因检测[2]
图1.非小细胞肺癌MET检测路径
  以MET 14号外显子跳跃突变为例,尽管可以通过DNA水平的检测发现,但目前国内的基因检测平台的可靠度还有进一步提升的空间,目前还无法单纯依靠基因检测机构得出最准确的基因检测结果。同时对MET 14号外显子跳跃突变这样新靶点的辨认仍需积累经验,这也导致现在临床医生在解读MET基因检测结果时可能需要逐个碱基核对,并且有时甚至需要多位医生共同确认。DNA二代测序平台检测结果为驱动基因全阴或疑似MET 14跳突阳性时,可考虑进行基于RNA水平的RT-qPCR或二代测序复测MET14跳突及其他融合基因。当组织样本/细胞学样本不可获得时,考虑使用液体样本进行二代测序检测MET 14跳突,当出现阴性结果时,应注明假阴性的可能性,必要时建议重取肿瘤组织样本进行复测。晚期NSCLC患者,尤其是EGFR-TKI耐药患者,推荐FISH检测MET基因扩增。临床已有二代测序检测MET基因扩增,但仍需进一步的优化和验证。此外,鉴于MET蛋白过表达在NSCLC MET抑制剂的临床治疗中具有潜在指导价值,当肿瘤组织较充足时,可考虑IHC检测MET蛋白过表达[2]
  晚期NSCLC MET检测首选肿瘤组织/细胞学样本,采用包括MET的多基因联检平台(RT-qPCR或二代测序)检测MET14跳突,DNA二代测序检测结果阴性时,可考虑采用RNA样本补充检测;晚期NSCLC患者尤其是EGFR-TKI耐药后患者推荐FISH检测MET基因扩增。当组织/细胞学样本不可及时,可选择液体活检样本进行MET14跳突的检测[2]。为了给新诊断的NSCLC患者选择最佳的前期治疗方案,临床医生必须使用基因检测来识别潜在的可靶向基因突变,包括现在的MET ex14跳读突变。MET ex14的跳读突变通常是基于组织的NGS检测来完成的,比如FDA批准的基于组织检测的F1CDx作为相关药物的伴随诊断;但当无法获取活检组织时,也可以使用液体活检,比如PMDA批准的基于组织/血液检测的ArcherMET CDx作为一些药物的伴随诊断。特别是检测MET外显子14跳读突变,VISION试验结果显示,在接受液体或组织活检以确定其突变的患者中,采用MET抑制剂治疗的ORR是相似的,这表明两种检测方法都可以确定从选择性MET抑制中获益的候选者。
参考文献:
[1] Zhao S, Zhang Z, Zhan J, et al. Utility of comprehensive genomic profiling in directing treatment and improving patient outcomes in advanced non-small cell lung cancer [J]. BMC Med, 2021, 19(1): 223.
[2] 中华医学会病理学分会,中国病理质控中心,中华医学会肿瘤学分会肺癌学组《非小细胞肺癌MET临床检测中国专家共识》,中华病理学杂志,2022,51(11):1094-1103