免疫组织化学是目前病理诊断过程中不可或缺的工具，其在肿瘤的良恶性鉴别、分化分型、起源判定以及微生物检测等方面发挥了重要作用。
软组织肿瘤是一组高度异质性的肿瘤，有时鉴别诊断十分困难。约1/3的软组织肿瘤都有特征性的分子改变，例如尤文肉瘤/原始神经外胚叶肿瘤（ES/PNET）、脂肪肉瘤
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